一般人对细菌的印象是，细菌是有害的、会让人生病的，但事实相反，有益的细菌远多余有害的。
例如，某些细菌的固氮作用能帮助土壤肥沃，细菌是食物链中非常重要的分解者，它们不但分解废弃物、避免尸体堆积，也把某些像蛋白质这类物质，转换成其他生物可以使用的东西。

植物和动物的生命都仰赖细菌的活动，如果没有细菌，各种营养素的循环就会打结。我们的肠道也有细菌，可以合成人体所需的维他命，也可以帮助消化某些东西。人如果服用大量的抗生素毁灭了肠道细菌生态，接着就会产生各种肠胃毛病。

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