真菌性角膜炎的危险因子包括：
角膜外伤(尤其是植物所造成)、局部施用类固醇药物、曾经接受过角膜手术(包括近视雷射、角膜移植、及白内障手术等)、病毒性角膜炎等。真菌性角膜炎的症状主要为异物感、眼睛红、疼痛、流泪、分泌物增加、畏光、视力模糊等；眼科检查发现主要包括结膜充血、化脓、角膜上皮损伤、间质浸润、前房发炎反应、前房蓄脓(hypopyon)等，非专一性病症。真菌性角膜炎较为专一的特征为：颗粒状浸润併有羽毛状边缘、表面略为突起灰白色且粗糙、初级病灶呈环状并伴有边缘的卫星病灶、化脓性间质炎併有前房蓄脓发炎甚至角膜穿孔等。
真菌性角膜炎与细菌性角膜炎、病毒性角膜炎、棘阿米巴角膜炎等，很难在外观上作鑑别诊断；因此在使用抗生素前的显微镜抹片检查(50%诊断率)及真菌培养(1星期的培养可达97%检出率)，是诊断真菌性角膜炎的重要步骤。若是已经接受广效性细菌抗生素后不见改善，才怀疑是真菌时，需考虑实施角膜切片检查，以确定诊断。
真菌性角膜炎的治疗主要为多烯键抗生素(polyene antibiotics)、氮唑类抗生素(azoles)、及氟化嘌嘧绽剂(fluorinated pyrimidines)等，一般用药须达3个月以上，如果治疗效果不佳还需使用外科手术治疗(可能高达四分之ㄧ的患者有此需要)。
