油藏微生物不同的培养温度获得了不同培养物。
不同的培养温度获得了不同的培养物。有趣的是，作者通过16S rR
NA基因序列分析，发现岩心样品中的微生物群落与钻井泥浆中的微
生物类型完全不同，表明岩心中发现的微生物具有油藏内源微生物
的潜质。
然而，大多数用于微生物研究的样品都取自于采油设备的产出
液体。油层采出水一般取自于储油罐、分离器和集输管线，故大部
分采集的样品并不是典型的油藏流体样品，因为这些设备很容易受
微生物污染。生物膜生长于设备表面，在水中释放出与油田内源微
生物无关的微生物，因此，采集油层采出水时应尽量采集井口的样
品。若油井选择恰当，采集的采出液来自于单一地层的单一采油区
，采出液将不会受到其他不同地化性质的油藏微生物的污染。采集
样品时应当避免被污染，由于油藏是一个厌氧生态系统，样品应避
免暴露于空气中。由此可知，取样前应先准备无氧无菌的容器，将
采样设备消毒灭菌，除去残留液。但即使如此，长达几百米甚至几
千米的油井生产管柱也容易形成生物膜而污染采出液。这些微生物
并不是全部来自于地层水，而部分是来自于井筒管柱。油井中硫酸
盐还原菌的生长，造成了所谓的油井酸化现象，证实了油井管柱本
身就是一个独特的生态系统。
微生物进入油藏的另一个途径是注水开采，无论注入水的来源
是什么，包括油层采出水的二次注入都会对油藏造成污染。因此，
研究真正的内源微生物应选择未被注水开发的油藏。
由于改进的钻井技术并未考虑用于油藏微生物的研究，因此这
些样品并不能完全反映地层环境。微生物学家只能推断分离自这些
样品中的特殊微生物的潜在内源特性。
