地质土壤、沉淀物、岩石和矿石微生物实验显微镜
自然界中的地质微生物学过程在实验室重现
为了研究微生物地质作用的机制需要在实验室中构建一个自然
状态下地理微生物作用过程是非常重要的。实验室通过应用与自然
界相比更有利的条件优化这个过程。例如利用一个纯的培养或一个
被纯化的共生体可以排除由于微生物竞争和最佳化底物，温度，pH
，Eh，以及提供的氧气和二氧化碳供给而产生的干扰。
生长在固体培养基如土壤、沉淀物、岩石和矿石的有机体的行
为可以采用批式培养，气柱，过滤器或恒化器来观察。批式培养就
是整个过程在一个密闭的系统中进行，在这个系统中起始培养基浓
度是固定的，这些培养基在培养的过程中逐渐被消耗掉。
在pH和E。条件下细胞数量和代谢产物的建立、变化很容易发生
。培养的条件不断变化而且变得越来越不利。批式实验仅能小规模
模拟自然过程，自然变化过程通常发生在一个敞开的系统，它伴随
着连续的或间歇的补给底物以及一些代谢废物的移除。气柱中培养
是一个部分开放系统，在柱中矿石上微生物进行生长和生化活动。
它们被循环的供给营养物供给，营养物被有机体不断消耗掉，同时
它们的代谢产物在循环系统也被从固体表面移走。过滤器与气柱相
比是一个更加开放的体系，微生物也是在柱子中固体底物上生长，
但它们不是用循环的供给方式添加营养物。在该系统中新鲜的营养
液可以连续或间歇形式加入，同时代谢废物不断的被带走，而pH、
E。和温度保持恒定或基本不变。恒化器中稳定的条件就是一个理
想的开放培养系统。因为条件太稳定了，所以与自然界条件有较大
差别。
